Разнообразие гаплогруппы R1a-Z2122 в субпопуляциях балкарцев и карачаевцев по данным микросателлитного разнообразия



Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Карачаевцы и балкарцы являются одними из самых высокогорных тюркских народов в мире, а их генетическая предыстория остаётся мало изученной. Целью работы является всестороннее изучение гаплогруппы R1a-Z2122 Y-хромосомы в популяции карачаевцев и в субэтнических группах балкарцев. Материалом для исследования послужили образцы ДНК карачаевцев (n=126) и балкарцев (n=235). Проведён анализ генетического разнообразия популяции карачаевцев и субпопуляций балкарцев, проживающих в центральной части Северо-Кавказского региона по данным о распределении гаплогрупп Y-SNP (single nucleotide polymorphism, однонуклеотидные полиморфизмы Y-хромосомы) и гаплотипов Y-STR (short tandem repeats, микросателлитные локусы Y-хромосомы). По результатам генотипирования гаплогруппы R1a-Z2122 в субпопуляциях балкарцев, гаплогруппа R1a-Z2122 выявлена с частотой 3,4%, а в популяции карачаевцев - 2,4%. В ходе изучения распространения данной гаплогруппы в субэтнических группах балкарцев показано ее высокое содержание в группе чегемцев, где она составляет 6,8% от разнообразия гаплогрупп Y-хромосомы. В группе баксанцев частота данной гаплогруппы снижается до 4,8%, среди безенгиевцев встречается у 2,6% населения, а среди малкарцев у 1,7%, в то время как в популяции холамцев данная гаплогруппа не обнаружена. Для анализа STR-гаплотипов Y-хромосомы было отобрано 11 образцов, относящихся к гаплогруппе R1a-Z2122. При построении медианной сети и круговой дендрограммы была показана существенная вариабельность внутри изученной выборки. Полученные данные могут быть использованы при разработке курсов для студентов биологических, исторических и медицинских специальностей. Созданную уникальную коллекцию ДНК образцов балкарцев и карачаевцев в последующем можно применять для проведения популяционных, эволюционных и медико-генетических исследований.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

М. А Джаубермезов

Башкирский государственный университет; Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение «Уфимского федерального исследовательского центра РАН»

Н. В Екомасова

Башкирский государственный университет; Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение «Уфимского федерального исследовательского центра РАН»

С. С Литвинов

Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение «Уфимского федерального исследовательского центра РАН»

Е. А Токарева

Башкирский государственный университет

Л. Р Габидуллина

Башкирский государственный университет

Р. Р Валиев

Башкирский государственный университет

А. Х Нургалиева

Башкирский государственный университет

Э. К Хуснутдинова

Башкирский государственный университет; Институт биохимии и генетики - обособленное структурное подразделение «Уфимского федерального исследовательского центра РАН»

Список литературы

  1. Федеральная служба государственной статистики, http://www.gks.ru
  2. Bulayeva K., Jorde L., Ostler C. et. al. Genetics and population history of Caucasus populations. Hum. Biol. 2003; 75(6): 837-53.
  3. Roostalu U., Kutuev I., Loogvali E.-L. et. al. Origin and Expansion of Haplogroup H., the Dominant Human Mitochondrial DNA Lineage in West Eurasia: the Near Eastern and Caucasian Perspective. Mol. Biol. Evol. 2007; 24(2): 436-48.
  4. Yunusbayev B., Metspalu M., Jarve M. et al. The Caucasus as an asymmetric semipermeable barrier to ancient human migrations. Mol. Biol. Evol. 2012; 29(1): 359-65.
  5. Khusnutdinova E.K., Litvinov S.S., Kutuev I.A. et al. Gene pool of ethnic groups of the Caucasus: Results of integrated study of the Y. chromosome and mitochondrial DNA and genome-wide data. Rus. J. Genetics 2012; 48(6): 640-50.
  6. Схаляхо Р.А. Тюрки Кавказа: сравнительный анализ генофондов по данным о Y-хромосоме. Вестник Московского университета. Серия XXIII. Антропология 2013; 2: 34-48.
  7. FamilyTree DNA, www.familytreedna.com.
  8. Karafet T.M., Mendez F.L., Meilerman M.B. et. al. New binary polymorphisms reshape and increase resolution of the human Y. chromosomal haplogroup tree. Genome Res. 2008; 18 (5): 830-8.
  9. Кутуев И.А., Хуснутдинова Э.К. Генетическая структура и молекулярная филогеография народов Евразии. Уфа: Гилем; 2011.
  10. Rootsi S., Behar D.M., Jarve M. et al. Phylogenetic applications of whole Y-chromosome sequences and the Near Eastern origin of Ashkenazi Levites. Nat. Commun. 2013; 4: 2928.
  11. Walsh B. Estimating the time to the most recent common ancestor for the Y. chromosome or mitochondrial DNA for a pair of individuals. Genetics 2001; 158(2): 897-912.
  12. Tracking Back. A website for genetic genealogy tools, experimentation, and discussion, http://scaledinnovation.com/gg/gg.html.

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML

© Эко-Вектор, 2021



СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: 

Данный сайт использует cookie-файлы

Продолжая использовать наш сайт, вы даете согласие на обработку файлов cookie, которые обеспечивают правильную работу сайта.

О куки-файлах