Eview — программа с открытым исходным кодом для преобразования и визуализации многоканальных электрофизиологических сигналов
- Авторы: Захаров А.В.1,2, Захарова Ю.П.1
-
Учреждения:
- Казанский (Приволжский) федеральный университет
- Казанский государственный медицинский университет
- Выпуск: Том 18, № 4 (2023)
- Страницы: 323-330
- Раздел: Оригинальные исследования
- Статья получена: 10.07.2023
- Статья одобрена: 05.09.2023
- Статья опубликована: 15.12.2023
- URL: https://genescells.ru/2313-1829/article/view/544170
- DOI: https://doi.org/10.23868/gc544170
- ID: 544170
Цитировать
Полный текст
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Доступ платный или только для подписчиков
Аннотация
Обоснование. Методы и средства работы с многоканальными электрофизиологическими сигналами должны развиваться и соответствовать скорости потока данных в современных экспериментах. Анализ и визуализация экспериментальных данных с минимальной задержкой и с минимизацией усилий экспериментатора — актуальная задача в области нейробиологии, которая требует использования комплексных подходов, специально подобранных для каждого конкретного типа эксперимента. Создание программ с открытым исходом кодом, которые могут быть оперативно адаптированы для различных задач, является одним из подходов, обеспечивающих возможность качественного проведения сложных научных экспериментов.
Цель — разработка программного обеспечения с открытым исходным кодом для аналитической и визуализационной поддержки экспериментов нейробиологического направления.
Методы. Программное обеспечение разработано в среде MATLAB. Программа построена по модульному принципу и включает интуитивно понятный графический интерфейс, облегчающий управление процессом преобразования и отображения сигналов.
Результаты. Создан программный инструмент, который позволяет оптимизировать и ускорить различные этапы электрофизиологических исследований, включая предварительный анализ качества готовящегося эксперимента, глубокий анализ записанных сигналов и подготовку иллюстративного материала для публикаций.
Заключение. Полученная программа имеет ряд преимуществ по сравнению с аналогичными продуктами в части универсальности, быстродействия и доступности и может быть использована при решении широкого класса исследовательских задач.
Полный текст
Об авторах
Андрей Викторович Захаров
Казанский (Приволжский) федеральный университет; Казанский государственный медицинский университет
Автор, ответственный за переписку.
Email: AnVZaharov@kpfu.ru
ORCID iD: 0000-0002-6175-9796
SPIN-код: 5181-0893
к.б.н.
Россия, Казань; КазаньЮлия Павловна Захарова
Казанский (Приволжский) федеральный университет
Email: 3axapova.71@gmail.com
ORCID iD: 0000-0002-4808-3541
SPIN-код: 6251-5722
Россия, Казань
Список литературы
- Nasretdinov A., Evstifeev A., Vinokurova D., et al. Full-band eeg recordings using hybrid ac/dc-divider filters // eNeuro. 2021. V. 8, N 4. P. ENEURO.0246-21.2021. doi: 10.1523/ENEURO.0246-21.2021
- Nasretdinov A., Lotfullina N., Vinokurova D., et al. Direct current coupled recordings of cortical spreading depression using silicone probes // Front Cell Neurosci. 2017. V. 11. P. 408. doi: 10.3389/fncel.2017.00408
- Dreier J.P., Fabricius M., Ayata C., et al. Recording, analysis, and interpretation of spreading depolarizations in neurointensive care: review and recommendations of the COSBID research group // J Cereb Blood Flow Metab. 2017. V. 37, N 5. P. 1595–1625. doi: 10.1177/0271678X16654496
- Vinokurova D., Zakharov A., Chernova K., et al. Depth-profile of impairments in endothelin-1 — induced focal cortical ischemia // J Cereb Blood Flow Metab. 2022. V. 42, N 10. P. 1944–1960. doi: 10.1177/0271678X221107422
- Lückl J., Lemale C.L., Kola V., et al. The negative ultraslow potential, electrophysiological correlate of infarction in the human cortex // Brain. 2018. V. 141, N 6. P. 1734–1752. doi: 10.1093/brain/awy102
Дополнительные файлы
