Dlinnaya nekodiruyushchaya RNK MORRBID svyazana s protsessingom pre-mRNK v gepatotsitakh

Abstract

Full Text

Длинные некодирующие РНК (днРНК) это РНК длиной более 200 нуклеотидов, которые не кодируют в своей последовательности белок и составляют наиболее обширную часть транскрибируемого генома. днРНК имеют множество функций в различных клеточных процессах, таких как ремоделирование хроматина, транскрипция, сплайсинг, трансляция и т. д. Некоторые днРНК имеют несколько транскриптов, которые могут обладать тка-неспецифичностью или выполнять различные функции в зависимости от условий. днРНК M0RRBID регулирует продолжительность жизни нейтрофильных гранулоцитов и эозинофильных гранулоцитов посредством транскрипционной регуляции гена, Bcl2l11, находящегося в непосредственном геномном окружении днРНК M0RRBID (Kotzin et al, Nature 2016). В нашей работе мы демонстрируем, что ингибирование экспрессии днРНК M0RRBID приводит к стагнации клеточного цикла на стадии перехода G2/M. Анализ протеома клеток с пониженной экспрессией гена M0RRBID показал значительное снижение экспрессии белков, вовлеченных в процессинг пре-мРНК, включая белки, принадлежащие к группе hnRNP, и несколько белков, являющихся составляющими U1 и U2 белковых сплайснг комплексов. Мы показали методом РНК пулдаун анализа, что M0RRBID напрямую взаимодействует с белками, участвующими в регуляции пре-мРНК процессинга. Также, транскриптомный анализ продемонстрировал многочисленные изменения альтернативного сплайсирования в клетах с нокдауном M0RRBID. Таким образом, было обнаружено, что днРНК M0RRBID может быть вовлечена в регуляцию созревания пре-мРНК и регуляцию сплайсинга в гепатоцитах.