METHYLATION OF GENE PROMOTERS IN CYTOTROFOBLAST IN MISCARRIAGES: CORRELATION WITH ANEUPLOIDY

Abstract

Full Text

Внутриутробная гибель эмбриона у человека чаще всего диагностируется в первом триместре беременности. Причиной смерти эмбриона часто становятся трисомии ау-тосом. Несбалансированность дозы генов, произошедшая в результате изменения числа хромосом при анеуплоидии, может стать причиной изменения степени метилирования ДНК в промоторах некоторых генов, что в результате отразиться на внутриутробном развитии плода. По нашим предварительным данным в выборке спонтанных аборту-сов с анеуплоидией наблюдается повышенный уровень метилирования в промоторах ряда генов. В настоящем исследовании был проведен более детальный анализ уровня метилирования в промоторах некоторых из этих генов - (ANKRD53, GATA3, CALCB, TRPV6, SCL13A4). Цель исследования-изучить взаимосвязь уровня метилирования CpG-сайтов промоторов генов (ANKRD53, GATA3, CALCB, TRPV6, sCl13a4) с наличием хромосомных нарушений у спонтанных абортусов I триместра беременности. Исследование проведено на основе биобанка НИИ медицинской генетики Томского НИМЦ. Для проведения молекулярно-генетического анализа из трофобласта хориона 22 абортусов с трисомным кариотипом и 10 медицинских абортусов, в качестве контрольной группы; выделялась ДНК, которая затем подвергалась бисульфитной модификации. С помощью ПЦР наработаны фрагменты модифицированной ДНК с несколькими CpG-сайтами. С помощью таргетного бисульфитного массового параллельного секве-нирования проанализирован индекс метилирования ДНК. Обнаружено гиперметилирование промоторов всех указанных генов у спонтанных абортусов с трисоми-ей 16. В частности, статистически значимые различия между группами наблюдались для гена ANKRD53, ответственного за расхождение хромосом в митозе, что может вносить вклад в природу мозаицизма, и транскрипционного фактора GATA3, отвечающего за дифференцировку клеток эмбриона. Данные результаты указывают на то, что трисомия 16 связана с эпигенетическими изменениями в геноме, сопровождающимися гибелью эмбриона на начальных этапах онтогенеза.