INFLUENCE OF INDUCIBLE AND STABLE HIV-1 TAT PROTEIN EXPRESSION ON EXPRESSION OF CELLULAR GENES IN CULTIVATED RPMI 8866 LYMPHOCYTES

Abstract

Full Text

Вирус иммунодефицита человека (ВИЧ) вызывает развитие синдрома приобретённого иммунодефицита. Важную роль в развитии вируса играет белок Tat (трансактиватор транскрипции). Помимо активации транскрипции вирусных генов, этот белок способен покидать инфицированную клетку и проникать в другие близлежащие клетки. В настоящее время для терапии ВИЧ применяется комбинированная антиретровирусная терапия, однако при ее использовании увеличивается частота развитие онкологических заболеваний, например, некоторых В-клеточных лимфом. Предполагается, что, как минимум частично, именно Tat белок отвечает за развитие онкологических заболеваний у ВИЧ-инфицированных пациентов. При этом можно ожидать, что клетка частично компенсирует эффекты Tat белка. Для выяснения возможности компенсации лимфоцитами эффектов вирусного белка была изучена экспрессия генов (RNA-seq) в культивируемых В-лимфоцитах линии RPMI 8866, постоянно или индуцибельно экспрессирующих Tat белок [1]. В ходе анализа были выявлены дифференциально-экспрессируемые гены и построены предсказания ключевых метаболических путей, на которые повлияла экспрессия Tat белка. Некоторые сделанные предсказания были проверены экспериментально. Показано, что индуцибельная экспрессия Tat белка изменяет экспрессию существенно большего числа генов (5592 гена), по сравнению со стабильной экспрессией (1150 генов). При этом индуцибельная экспрессия затрагивает пути связанные с регуляцией пролиферации, репарации и сплайсинга. Эффекты стабильной экспрессии были менее выраженными. При стабильной экспрессии проявились категории, связанные с иммунными реакциями. Анализ клеток подтверждает, что индуци-бельная, но не стабильная экспрессия Tat белка сильно влияет на пролиферацию клеток. Таким образом, клетка, действительно способна компенсировать эффекты Tat белка.