Dlinnaya nekodiruyushchaya rnk LL35 yavlyaetsya novym regulyatorom ekspressii genov v pecheni myshi

Abstract

Full Text

Открытие и изучение новых некодирующих РНК я вляется одним из динамично развивающихся направлений молекулярной билогии. Накопленные научные знания свидетельствуют об участии днРНК в различных биологических процессах, включая иммунный ответ, клеточное деление и дифферен-цировку. Известно, что днРНК человека DEANR1 участвует в регулировании дифференцировки эндотермы в эмбриональных стволовых клетках человека. DEANR1 способствует связыванию SMAD2/3 белков с промоторной областью Foxa2, что приводит к активации транскрипции Foxa2 (W. Jianget al., 2015). Транскрипционный фактор Foxa2 необходим для развития печени из энтодермы (C. Leeetal, 2005). Кроме того, Foxa2 является транскрипционным активатором печень-специфических генов альбумина и трансферрина и играет важную роль в гомеостазе глюкозы в печени (K. Kaestneret al., 1994). При анализе геномного окружения фактора Foxa2 в геноме мыши, нами был обнаружен потенциальный гомолог днРНК DEANR1 - РНК LL35. Можно предположить, что днРНК LL35 участвует в регуляции транскрипции фактора Foxa2 в печени, и, как следствие, может оказать влияние на метаболические процессы и различные заболевания печени. Таким образом, целью данного проекта является изучение роли днРНК LL35 in vitro и in vivo, а результаты данной работы позволят оценить потенциальную терапевтическую и диагностическую значимость ее гомолога в человеке DEANR1 in vivo. Первым этапом данной работы был биоинформатический анализ представленности транскриптов днРНК в печени мыши. После чего был проведен дизайн и синтез синтетических модифицированных миРНК для получения нокдауна РНК LL35 методом РНК-интерференции в клетках гепатомы мыши Hepa1-6. В результате был отобран набор миРНК, ингибирующий все экзоны днРНК LL35, представленные в печени мыши, определена их ингибирующая концентрация и начато изучение фенотипа клеток со сниженной экспрессией днРНК LL35.