DOCKING AND CONFORMATION ANALYSIS OF THE PIPERASIN DERIVATIVE OF A POTENTIAL THERAPEUTIC DRUG FOR THE TREATMENT OF ALZHEIMER'S DISEASE

详细

全文:

Болезнь Альцгеймера (БА) - это нейродегенератив-ное заболевание, поражающее в большинстве случаев людей преклонного возраста, отличительной чертой которого является прогрессирующая потеря памяти, вызванной синаптической дисфункцией. Настоящая работа основана на кальциевой гипотезе нейродегене-ративных заболеваний [1]. В данной работе представлены результаты исследований взаимодействия биоактивных соединений производных пиперазина (ПП) на неселективные кальциевые каналы TRPC6, которые вовлечены в процесс патогенеза БА. Ранее было показано, что ПП и, в частности, 51164, который был взят из базы данных IBS (г. Черноголовка, Россия), является потенциальным активатором TRPC6 [2]. В качестве контроля был использован гиперфорин взятый из базы данных PubChem (CID:441298). Трехмерную структуру TRPC6 взяли из UniProt с номером KB: Q9Y210. Докинг анализ проводился с использованием AutoDock Vina [3]. Полученные пространственные и энергетические параметры взаимодействия свидетельствуют, что гипер-форин и 51164 взаимодействуют с активным центром (АЦ) белка TRPC6 с энергиями связывания -7,7 ± 0.38 и -7,1± 0.35 ккал/моль соответственно. Были рассчитаны значения констант связывания для обоих взаимодействий, которые ровны 4,6X105 для гиперфорина и 1,7X 105 для 51164. Полученные результаты конформацион-ного анализа свидетельствуют, что у 51164 взаимодействия несет гидрофобный характер, когда у гиперфорина наблюдается единичные водородные связи с аминокислотными остатками ILE613, ASN617.