Аллогенная трансплантация гемопоэтических стволовых клеток (алло-ТГСК) остается единственным универсальным методом, позволяющим добиться излечения ряда наследственных заболеваний, таких как первичные иммунодефициты (ПИД), в том числе тяжелые комбинированные иммунодефициты (ТКИН), гемоглобинопатии и другие гематологические и моногенные заболевания. Однако процедура алло-ТГСК сопряжена с высоким риском развития тяжелых осложнений, особенно в случае отсутствия HLA-совместимого родственного донора и снижения соматического статуса больного на момент трансплантации. Альтернативным подходом является исправление генетического дефекта в аутогенных ГСК пациента при помощи методов генной терапии. Существующая парадигма генной терапии ГСК включает использование вирусного переноса функциональной копии гена, что сопряжено с риском тяжелых осложнений, связанных с инсерционным мутагенезом. В последние годы были разработаны технологии сайт-специфического редактирования генома с использованием рекомбинантных эндонуклеаз, таких как ZFN, TALEN и CRISPR/Cas9, способных инициировать двухцепочечные разрывы ДНК и интеграцию функциональной копии гена в строго определенном целевом локусе генома. Данный обзор посвящен достижениям и проблемам подходов генной терапии с использованием инструментов сайтспецифического редактирования генома на основе трансплантации гемопоэтических стволовых клеток.