Поиск Кабинет

ДНК «минимальных» клеток (микоплазм) в метагеномах вечной мерзлоты

Гены & Клетки: Том X, №3, 2015 год, стр.: 12-21

 

Авторы

Вишняков И.Е., Борхсениус С.Н., Каюмов А.Р., Шмакова Л.А., Ривкина Е.М.

ДЛЯ ТОГО ЧТОБЫ СКАЧАТЬ СТАТЬЮ В ФОРМАТЕ PDF ВАМ НЕОБХОДИМО АВТОРИЗОВАТЬСЯ, ЛИБО ЗАРЕГИСТРИРОВАТЬСЯ

В вечной мерзлоте в течение длительного геологического времени могут сохраняться ферменты, нуклеиновые кислоты, вирусы и жизнеспособные микроорганизмы. Сложно получить целостное представление о микробном сообществе многолетнемерзлых толщ, используя только классические микробиологические методы. Анализ метагеномов вечной мерзлоты позволил обнаружить генетический материал древних микоплазм – патогенов человека, животных и растений. Отбор образцов, выделение тотальной ДНК из почвы, секвенирование (Illumina), обработка метагеномных данных (MG-RAST, M5nr, UniProt, Krona). Предсказан видовой состав микоплазм в почвенных образцах многолетнемерзлых отложений Арктики различного происхождения, но сопоставимого возраста (31–32 тыс. лет). Выполнен сравнительный анализ коротких полипептидов, кодируемых фрагментами древней ДНК, с участками белков современных микоплазм. Обсуждаются филогенетическая история Mollicutes, пластичность их генома и патогенный потенциал вечной мерзлоты.

Подняться вверх сайта