<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>
<!DOCTYPE root>
<article xmlns:mml="http://www.w3.org/1998/Math/MathML" xmlns:xlink="http://www.w3.org/1999/xlink" xmlns:xsi="http://www.w3.org/2001/XMLSchema-instance" xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" article-type="research-article" dtd-version="1.2" xml:lang="en"><front><journal-meta><journal-id journal-id-type="publisher-id">Genes &amp; Cells</journal-id><journal-title-group><journal-title xml:lang="en">Genes &amp; Cells</journal-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Гены и Клетки</trans-title></trans-title-group><trans-title-group xml:lang="zh"><trans-title>Genes and Cells</trans-title></trans-title-group></journal-title-group><issn publication-format="print">2313-1829</issn><issn publication-format="electronic">2500-2562</issn><publisher><publisher-name xml:lang="en">Human Stem Cells Institute</publisher-name></publisher></journal-meta><article-meta><article-id pub-id-type="publisher-id">643089</article-id><article-id pub-id-type="doi">10.17816/gc643089</article-id><article-id pub-id-type="edn">GUONMK</article-id><article-categories><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="en"><subject>Original Study Articles</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="toc-heading" xml:lang="ru"><subject>Оригинальные исследования</subject></subj-group><subj-group subj-group-type="article-type"><subject>Research Article</subject></subj-group></article-categories><title-group><article-title xml:lang="en">Analysis of the neurogenic potential of a three-dimensional culture of mouse dorsal root ganglia explants</article-title><trans-title-group xml:lang="ru"><trans-title>Анализ нейрогенного потенциала трёхмерной культуры эксплантов спинномозговых ганглиев мыши</trans-title></trans-title-group></title-group><contrib-group><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-5929-2963</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">8767-5228</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Vorobev</surname><given-names>Mikhail L.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Воробьев</surname><given-names>Михаил Леонидович</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><email>mlv@incras.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0003-0545-5437</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">1816-4676</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Bystrova</surname><given-names>Olga A.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Быстрова</surname><given-names>Ольга Алексеевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Cand. Sci. (Biology)</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>канд. биол. наук</p></bio><email>o3608338@gmail.com</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0002-0894-4095</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">3103-5755</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Martynova</surname><given-names>Marina G.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Мартынова</surname><given-names>Марина Георгиевна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Dr. Sci. (Biology)</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>д-р биол. наук</p></bio><email>mgmart14@mail.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib><contrib contrib-type="author"><contrib-id contrib-id-type="orcid">https://orcid.org/0000-0001-7992-2435</contrib-id><contrib-id contrib-id-type="spin">7912-0574</contrib-id><name-alternatives><name xml:lang="en"><surname>Suvorova</surname><given-names>Irina I.</given-names></name><name xml:lang="ru"><surname>Суворова</surname><given-names>Ирина Игоревна</given-names></name></name-alternatives><address><country country="RU">Russian Federation</country></address><bio xml:lang="en"><p>Cand. Sci. (Biology)</p></bio><bio xml:lang="ru"><p>канд. биол. наук</p></bio><email>irsuvorov@yandex.ru</email><xref ref-type="aff" rid="aff1"/></contrib></contrib-group><aff-alternatives id="aff1"><aff><institution xml:lang="en">Institute of Cytology of the Russian Academy of Sciences</institution></aff><aff><institution xml:lang="ru">Институт цитологии Российской академии наук</institution></aff></aff-alternatives><pub-date date-type="preprint" iso-8601-date="2025-10-10" publication-format="electronic"><day>10</day><month>10</month><year>2025</year></pub-date><pub-date date-type="pub" iso-8601-date="2026-02-04" publication-format="electronic"><day>04</day><month>02</month><year>2026</year></pub-date><volume>20</volume><issue>4</issue><issue-title xml:lang="en"/><issue-title xml:lang="ru"/><fpage>325</fpage><lpage>336</lpage><history><date date-type="received" iso-8601-date="2024-12-16"><day>16</day><month>12</month><year>2024</year></date><date date-type="accepted" iso-8601-date="2025-08-01"><day>01</day><month>08</month><year>2025</year></date></history><permissions><copyright-statement xml:lang="en">Copyright ©; 2026, Eco-Vector</copyright-statement><copyright-statement xml:lang="ru">Copyright ©; 2026, Эко-Вектор</copyright-statement><copyright-year>2026</copyright-year><copyright-holder xml:lang="en">Eco-Vector</copyright-holder><copyright-holder xml:lang="ru">Эко-Вектор</copyright-holder><ali:free_to_read xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/" start_date="2029-02-04"/><license><ali:license_ref xmlns:ali="http://www.niso.org/schemas/ali/1.0/">https://eco-vector.com/for_authors.php#07</ali:license_ref></license></permissions><self-uri xlink:href="https://genescells.ru/2313-1829/article/view/643089">https://genescells.ru/2313-1829/article/view/643089</self-uri><abstract xml:lang="en"><p><bold>BACKGROUND:</bold> Cultivation of dorsal root ganglia (DRGs) is a widely used approach for modeling physiological and pathological conditions of the peripheral nervous system <italic>in vitro</italic>. Existing scientific data indicates that postnatal DRGs contain a pool of glial stem cells capable of differentiating into neurons after injury. Therefore, isolated DRGs containing a stem cell pool may retain neurogenic potential <italic>ex vivo</italic>. However, no studies in the available scientific data have investigated the preservation of the regenerative potential of DRGs <italic>ex vivo</italic>.</p> <p><bold>AIM:</bold> This study aimed to evaluate the neurogenic potential of isolated DRGs and establish a three-dimensional organotypic culture from these explants.</p> <p><bold>METHODS:</bold> DRGs were isolated from the cervical, thoracic, and lumbar regions of the spine and cultured short-term and long-term as three-dimensional explants in Geltrex gel. The morphology, ultrastructure, and gene expression profile of the cultured DRGs were analyzed using light and electron microscopy, immunofluorescent staining, and quantitative reverse transcription polymerase chain reaction.</p> <p><bold>RESULTS:</bold> DRGs cultured in Geltrex for 14 days consistently generated a three-dimensional periganglionic network composed of radially branching elongated cells. Immunofluorescent staining with Tuj1 antibodies (neuron-specific class III β-tubulin) demonstrated that the observed cells were neuronal. Immunostaining with O4 antibodies confirmed that Tuj1-positive cells were not migrating Schwann cells. Quantitative reverse transcription polymerase chain reaction analysis of total RNA extracted from the DRG explant cultures revealed a significant increase in mRNA levels of key neurogenesis-related genes, such as <italic>Neurog1</italic>, <italic>Neurog2</italic>, and <italic>Sox2</italic>, indicating activation of a neurogenic program in the cultured explants. Light and electron microscopy showed that adult sensory neurons degenerated within the DRG explants and did not contribute to the periganglionic network. Using available confocal capabilities, we evaluated three-dimensional parameters of the periganglionic network from two-dimensional microscopic images to demonstrate the topography of Tuj1-expressing neuronal cells in a DRG explant culture.</p> <p><bold>CONCLUSION:</bold> We characterized a three-dimensional culture of DRGs. Isolated explants demonstrate regenerative capacity under <italic>in vitro</italic> conditions. They may represent a novel organotypic model with neurogenic potential. The obtained model may be relevant for studying regenerative processes in DRGs, expanding research opportunities beyond traditional stem cell–derived models.</p></abstract><trans-abstract xml:lang="ru"><p><bold>Обоснование.</bold> Культивирование спинномозговых ганглиев является широко используемым подходом для моделирования физиологических и патологических состояний периферической нервной системы <italic>in vitro</italic>. Имеющиеся литературные данные указывают на то, что постнатальные спинномозговые ганглии содержат пул глиальных стволовых клеток, которые способны дифференцироваться в нейроны после травмы. Следовательно, извлечённые спинномозговые ганглии, содержащие пул стволовых клеток, могут обладать нейрогенным потенциалом <italic>ex vivo</italic>. Однако в доступной литературе мы не нашли работ, исследующих сохранение регенеративного потенциала спинномозговых ганглиев <italic>ex vivo</italic>.</p> <p><bold>Цель.</bold> В данном исследовании мы оценили нейрогенный потенциал изолированных спинномозговых ганглиев и создали трёхмерную органотипическую культуру из этих эксплантов.</p> <p><bold>Методы.</bold> Мышиные спинномозговые ганглии, выделенные из шейного, грудного и поясничного отделов позвоночника, краткосрочно и долгосрочно культивировали в виде трёхмерной культуры в геле Geltrex. Морфологию, ультраструктуру и профиль экспрессии генов культивируемых спинномозговых ганглиев анализировали с помощью световой и электронной микроскопии, иммунофлуоресцентного окрашивания и количественной полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией.</p> <p><bold>Результаты.</bold> Установлено, что спинномозговые ганглии, культивируемые в Geltrex в течение 14 дней, стабильно генерировали трёхмерную периганглионарную сеть, состоящую из радиально разветвлённых удлинённых клеток. Иммунофлуоресцентное окрашивание антителами против Tuj1 (нейронспецифический бета-тубулин класса III) показало, что наблюдаемые клетки были нейрональными клетками. Иммуноокрашивание антителами против O4 подтвердило, что клетки, маркированные Tuj1, не были мигрирующими Шванновскими клетками. Количественный анализ общей РНК, выделенной из культуры эксплантов спинномозговых ганглиев с помощью полимеразной цепной реакции с обратной транскрипцией, выявил значительное увеличение матричной РНК ключевых генов, связанных с нейрогенезом, таких как <italic>Neurog1</italic>, <italic>Neurog2</italic> и <italic>Sox2</italic>, что указывает на активацию нейрогенной программы в культивируемых эксплантах. Световая и электронная микроскопия показали, что взрослые сенсорные нейроны дегенерировали в эксплантах спинномозговых ганглиев и не вносили вклад в периганглионарную сеть. Используя доступные конфокальные возможности, мы оценили трёхмерные параметры периганглионарной сети по двумерным микроскопическим изображениям, чтобы продемонстрировать топографию нейрональных клеток, экспрессирующих Tuj1, в культуре эксплантов спинномозговых ганглиев.</p> <p><bold>Заключение.</bold> Охарактеризована трёхмерная культура спинномозговых ганглиев. Обнаружено, что выделенные экспланты демонстрируют регенеративную способность в условиях культивирования <italic>in vitro</italic> и могут представлять собой новую органотипическую модель с нейрогенным потенциалом. Полученная модель может быть релевантной для изучения процессов регенерации в спинномозговых ганглиях, расширяя возможности исследований за пределами традиционных двумерных культур, получаемых из стволовых клеток.</p></trans-abstract><kwd-group xml:lang="en"><kwd>dorsal root ganglia</kwd><kwd>Tuj1 protein</kwd><kwd>peripheral neurons</kwd><kwd>neurogenesis</kwd></kwd-group><kwd-group xml:lang="ru"><kwd>спинномозговые ганглии</kwd><kwd>белок Tuj1</kwd><kwd>периферические нейроны</kwd><kwd>нейрогенез</kwd></kwd-group><funding-group><funding-statement xml:lang="en">This study was supported by the Russian Science Foundation (grant No. 23-25-10017) and the St. Petersburg Science Foundation (grant No. 23-25-10017)</funding-statement><funding-statement xml:lang="ru">Исследование выполнено за счёт гранта Российского научного фонда № 23-25-10017 и гранта Санкт-Петербургского научного фонда № 23-25-10017</funding-statement></funding-group></article-meta></front><body></body><back><ref-list><ref id="B1"><label>1.</label><mixed-citation>La Forte RA, Melville S, Chung K, Coggeshall RE. Absence of neurogenesis of adult rat dorsal root ganglion cells. Somatosens Mot Res. 1991;8(1):3–7. doi: 10.3109/08990229109144723</mixed-citation></ref><ref id="B2"><label>2.</label><mixed-citation>Pover CM, Barnes MC, Coggeshall RE. Do primary afferent cell numbers change in relation to increasing weight and surface area in adult rats? Somatosens Mot Res. 1994;11(2):163–167. doi: 10.3109/08990229409028869</mixed-citation></ref><ref id="B3"><label>3.</label><mixed-citation>Mohammed HA, Santer RM. Total neuronal numbers of rat lumbosacral primary afferent neurons do not change with age. Neurosci Lett. 2001;304(3):149–152. doi: 10.1016/s0304-3940(01)01781-5</mixed-citation></ref><ref id="B4"><label>4.</label><mixed-citation>Namaka MP, Sawchuk M, MacDonald SC, et al. Neurogenesis in postnatal mouse dorsal root ganglia. Exp Neurol. 2001;172(1):60–69. doi: 10.1006/exnr.2001.7761</mixed-citation></ref><ref id="B5"><label>5.</label><mixed-citation>Li HY, Say EH, Zhou XF. Isolation and characterization of neural crest progenitors from adult dorsal root ganglia. Stem Cells. 2007;25(8):2053–2065. doi: 10.1634/stemcells.2007-0080</mixed-citation></ref><ref id="B6"><label>6.</label><mixed-citation>Gu Y, Hu N, Liu J, et al. Isolation and differentiation of neural stem/progenitor cells from fetal rat dorsal root ganglia. Sci China Life Sci. 2010;53(9):1057–1064. doi: 10.1007/s11427-010-4053-x EDN: ZLXEDM</mixed-citation></ref><ref id="B7"><label>7.</label><mixed-citation>Zhang L, Xie R, Yang J, et al. Chronic pain induces nociceptive neurogenesis in dorsal root ganglia from Sox2-positive satellite cells. Glia. 2019;67(6):1062–1075. doi: 10.1002/glia.23588</mixed-citation></ref><ref id="B8"><label>8.</label><mixed-citation>Hu H, Ding Y, Mu W, et al. DRG-derived neural progenitors differentiate into functional enteric neurons following transplantation in the postnatal colon. Cell Transplant. 2019;28(2):157–169. doi: 10.1177/0963689718811061</mixed-citation></ref><ref id="B9"><label>9.</label><mixed-citation>Maniglier M, Vidal M, Bachelin C, et al. Satellite glia of the adult dorsal root ganglia harbor stem cells that yield glia under physiological conditions and neurons in response to injury. Stem Cell Reports. 2022;17(11):2467–2483. doi: 10.1016/j.stemcr.2022.10.002 EDN: ZKGYXS</mixed-citation></ref><ref id="B10"><label>10.</label><mixed-citation>Muratori L, Ronchi G, Raimondo S, et al. Generation of new neurons in dorsal root ganglia in adult rats after peripheral nerve crush injury. Neural Plast. 2015;2015:860546. doi: 10.1155/2015/860546 EDN: URBHLN</mixed-citation></ref><ref id="B11"><label>11.</label><mixed-citation>Schneider CA, Rasband WS, Eliceiri KW. NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis. Nat Methods. 2012;9(7):671–675. doi: 10.1038/nmeth.2089</mixed-citation></ref><ref id="B12"><label>12.</label><mixed-citation>Lorenz MR, Brazill JM, Beeve AT, et al. A Neuroskeletal Atlas: spatial mapping and contextualization of axon subtypes innervating the long bones of C3H and B6 mice. J Bone Miner Res. 2021;36(5):1012–1025. doi: 10.1002/jbmr.4273 EDN: RPGXWP</mixed-citation></ref><ref id="B13"><label>13.</label><mixed-citation>Stratton JA, Holmes A, Rosin NL, et al. Macrophages regulate schwann cell maturation after nerve injury. Cell Rep. 2018;24(10):2561–2572.e6. doi: 10.1016/j.celrep.2018.08.004 EDN: YKHKOD</mixed-citation></ref><ref id="B14"><label>14.</label><mixed-citation>Ye J, Coulouris G, Zaretskaya I, et al. Primer-BLAST: a tool to design target-specific primers for polymerase chain reaction. BMC Bioinformatics. 2012;13:134. doi: 10.1186/1471-2105-13-134 EDN: NWQKWQ</mixed-citation></ref><ref id="B15"><label>15.</label><mixed-citation>Sleigh JN, Weir GA, Schiavo G. A simple, step-by-step dissection protocol for the rapid isolation of mouse dorsal root ganglia. BMC Res Notes. 2016;9:82. doi: 10.1186/s13104-016-1915-8 EDN: CGDMZD</mixed-citation></ref><ref id="B16"><label>16.</label><mixed-citation>Klimovich P, Rubina K, Sysoeva V, et al. Three-dimensional model of dorsal root ganglion explant as a method of studying neurotrophic factors in regenerative medicine. Biomedicines. 2020;8(3):49. doi: 10.3390/biomedicines8030049 EDN: JVLTGW</mixed-citation></ref><ref id="B17"><label>17.</label><mixed-citation>Perner C, Sokol CL. Protocol for dissection and culture of murine dorsal root ganglia neurons to study neuropeptide release. STAR Protoc. 2021;2(1):100333. doi: 10.1016/j.xpro.2021.100333 EDN: MTEAEQ</mixed-citation></ref><ref id="B18"><label>18.</label><mixed-citation>Memberg SP, Hall AK. Dividing neuron precursors express neuron-specific tubulin. J Neurobiol. 1995;27(1):26–43. doi: 10.1002/neu.480270104</mixed-citation></ref><ref id="B19"><label>19.</label><mixed-citation>Mirsky R, Dubois C, Morgan L, et al. 04 and A007-sulfatide antibodies bind to embryonic Schwann cells prior to the appearance of galactocerebroside; regulation of the antigen by axon-Schwann cell signals and cyclic AMP. Development. 1990;109(1):105–116. doi: 10.1242/dev.109.1.105</mixed-citation></ref></ref-list></back></article>
