AFFECT OF GRE-LIKE PROTEINS FROM STRESS RESISTANT BACTERIUM DEINOCOCCUS GOBIENSIS ON TRANSCRIPTION

Abstract

Full Text

Бактерия Deinococcus gobiensis выдерживает до 15000 Гр у-излучения, что делает ее одной из самых радиоустойчивых бактерий, известных на данный момент. Механизмы, отвечающие за выживание в стрессовых условиях, продолжают активно исследоваться. Однако уже сейчас понятно, что чрезвычайная стрес-соустойчивость бактерий Deinococcus - это результат комбинации множества факторов. Своевременное включение адаптационных механизмов в ответ на стрессовое воздействие требует сложной регуляции транскрипции. Согласно данным, полученным при исследовании бактерий D. radiodurans и D. peraridilitoris, в этот процесс могут быть вовлечены Gre-подобные транскрипционные факторы, связывающиеся во вторичном канале РНК-полимеразы (РНКП) и не образующие прямых контактов с ДНК. В этой работе мы анализировали in vitro два белка D. gobiensis из группы Gre-подобных белков: GreA и Gfh1. Мы выделили РНК-полимеразу из клеток D. gobiensis, а также белки GreA и Gfh1 D. gobiensis, экспрессированные в клетках E. coli. Затем мы исследовали эффекты Gre-подобных белков на различные стадии транскрипционного цикла в in vitro системах транскрипции. Мы показали, что оба Gre-подобных фактора проявляют транскрипционные свойства, аналогичные своим гомологам в других бактериях рода Deinococcus. GreA активирует эндонуклеазное расщепление и усиливает остановку РНКП в участках ДНК, содержащих поврежденные нуклеотиды. Gfh 1 ингибирует синтез РНК уже на стадии инициации транскрипции, а также усиливает терминацию транскрипции. Результаты этой работы свидетельствуют об универсальности механизма регуляции работы РНКП Gre-подобными белками у бактерий рода Deinococcus и дают дополнительные основания предполагать роль этих транскрипционных факторов в стрессоустойчивости.