Inaktivatsiya Kh-khromosomy ne korreliruet s metilirovniem gena AR v indutsirovannykh plyuripotentnykh stvolovykh kletkakh cheloveka

Abstract

Full Text

У млекопитающих в каждой клетке в раннем эмбриональном развитии происходит процесс дозовой компенсации генов: одна из двух Х-хромосом становится транскрипционно неактивной, и в дальнейшем во всех соматических клетках находится в неактивном состоянии. Эмбриональные стволовые клетки (ЭСК), так же, как и клетки с индуцированной плюрипотентностью (ИПСК), являются моделью для изучения раннего развития. В женских ИПСК и ЭСК человека одна из Х-хромосом всегда активна, состояние второй вариабельно: может быть полностью активна, так и иметь частичную инактивацию, или же, аналогично соматическим, может быть полностью неактивной. Определение состояния инактивации Х-хромосомы в плю-рипотентных стволовых клетках человека (ПСК) является непростой и актуальной задачей, однако, различные методы определения состояния инактивации зачастую приводят к противоречивым результатам. В клинических лабораториях широко используется метод анализа метилирования гена AR, который позволяет определить соотношение аллелей инактивированной Х-хромосомы в клетках крови и тканях пациентов. Также этот метод ранее был предложен для определения статуса инактивации в ИПСК человека. В данной работе мы проанализировали состояние инактивации Х-хромосомы в линии ИПСК человека стандартными методами: экспрессия гена XIST, метилирование промотора XIST, модификации гистонов и др., а также по уровню метилирования гена AR с фрагментным анализом. Мы выяснили, что метилирование локуса AR не коррелируют с состоянием инактивации Х-хромосомы в женских ИПСК. Таким образом, мы предполагаем, что этот маркерный ген не может служить индикатором инактивации Х-хромосомы в женских линиях ИПСК человека.