Issledovanie differentsial'noy ekspressii i signal'nykh putey v skeletnoy muskulature patsientov s KhSN posle fizicheskoy reabilitatsii



Cite item

Full Text

Abstract

Full Text

Хроническая сердечная недостаточность (ХСН) является одним из самых распространённых заболеваний в мире. Одним из следствий ХСН является потеря функциональности мышечной ткани, характеризующееся атрофией, изменением типа миофибрилл, нарушением метаболизма. С другой стороны, физические упражнения являются эффективным методом лечения больных ХСН и повышения толерантности к физической нагрузке. Однако, молекулярные механизмы, ответственные за восстановление скелетной мускулатуры при физических упражнениях остаются неизвестными. Цель работы - исследовать дифференциальную экспрессию генов и сигнальные пути в мышечной ткани пациентов с ХСН, прошедших физическую реабилитацию. Методы. Биопсии скелетной мускулатуры трех пациентов были собраны до и после 12 недельного периода упражнений (6 шт.). Из образцов была выделена РНК и секвенирована на Illumina MiSeq. Полученные данные были обработаны в R Studio с использованием пакетов DESeq2 для анализа дифференциальной экспрессии генов (ДЕГ) до и после физических упражнений и fgsea для анализа сигнальных путей; контроль частоты ложных открытий (FDR) был 0.1. В качестве клеточной модели регенерации скелетной мускулатуры была выбрана линия миобластов C2C12; мышечная дифференцировка запускалась средой с 2% лошадиной сывороткой; РНК была выделена на д0 и д4 и секвенирована. ДЕГ, найденные в мышечной ткани пациентов с ХСН и клеточной модели сравнивались между собой. Результаты. Физические тренировки пациентов с ХСН привели к повышению толерантности к физической нагрузке. РНК-секвенирование биопсий выявило 26 сигнальных путей, активированных после физических упражнений. Обнаруженные ДЕГ и пути отвечают за активацию регенерации мышечной ткани, дифференцировку стволовых клеток (MEF2, MyoD, HSP90, IER5), сокращение и релаксацию мышц (MYH7, ACTA1, TNNT1, MYOM1), структуру миофи-брилл (ACTB, ACTG1, GSC, FLNC, PLEC, KLHL40), ме-ханотрансдукцию (CYR61), функции митохондрий (SLC25A4, NDUFS3, LYRM7, ND6). Клеточная модель для исследования регенерации скелетной мускулатуры С2С12 показала активацию таких же сигнальных путей при запуске дифференцировки; экспрессия ДЕГ, найденных в мышцах пациентов, была также повышена в дифференцированных миобластах С2С12. Данная работа описывает дифференциальную экспрессию генов и сигнальные пути в скелетной мускулатуре пациентов с ХСН, прошедших физическую реабилитацию.
×

References

Supplementary files

Supplementary Files
Action
1. JATS XML
Download

Copyright (c) 2019 Eco-Vector


СМИ зарегистрировано Федеральной службой по надзору в сфере связи, информационных технологий и массовых коммуникаций (Роскомнадзор).
Регистрационный номер и дата принятия решения о регистрации СМИ: